239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0340 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
93 aa  184  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  67.19 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  59.04 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  55.07 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  58.46 
 
 
230 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  43.75 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  52.86 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  39.77 
 
 
390 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.04 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  55 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  55 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 
57 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  41.1 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  47.89 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  40.91 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  47.17 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  42.42 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.62 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.94 
 
 
72 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  44.26 
 
 
75 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 
80 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
69 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
86 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  42.67 
 
 
189 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  42.67 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 
209 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 
216 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.33 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 
208 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  44.44 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.24 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 
195 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  41.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 
83 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
199 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
179 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  37.88 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>