More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0122 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  75 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  73.61 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  67.8 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  58.21 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  49.25 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  40.3 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 390 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  43.75 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  38.57 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2538  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0200677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  36.71 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  46.67 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  41.79 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 252 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.59 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  44.64 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 256 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 212 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 383 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>