More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3530 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  88.66 
 
 		 97 aa  173  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  87.63 
 
 		 97 aa  170  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  92.31 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  78.72 
 
 		 98 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  69.07 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  68.04 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  68.42 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 99 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  68.13 
 
 		 102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 97 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  49.32 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  43.75 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  47.69 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  47.69 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  33.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  41.43 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  40 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 233 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 248 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  36.23 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 180 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  43.08 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>