176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4271 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  91.18 
 
 		 68 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  89.71 
 
 		 68 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 68 aa  120  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 68 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 68 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  75 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  72.06 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  65.67 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  57.35 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  44.62 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  43.08 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  40.3 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  46.3 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  36.51 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.37 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  36.36 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 390 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  46.55 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  46.55 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  38.98 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  36.36 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  37.31 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  39.39 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 333 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 333 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  36.51 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  36.51 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>