223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0196 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  100 
 
 		 77 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  100 
 
 		 77 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  53.42 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  53.73 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  53.97 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  49.3 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.93 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  53.52 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  43.48 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  52.54 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  45 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  39.68 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  44.44 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  47.06 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  59.18 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  53.19 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 333 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  48.28 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.24 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  43.48 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>