298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3590 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  75.76 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  65.15 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  60.38 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  57.38 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  52.31 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  51.67 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  55.36 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  48.39 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  50.82 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  45.9 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 76 aa  57  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  47.69 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.1 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 390 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  41.18 
 
 		 222 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  42.47 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  43.33 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  46.03 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  42.37 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  42.37 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>