280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1806 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  49.35 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  43.33 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  50 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  50 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
230 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  36.23 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.26 
 
 
72 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.26 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  46.58 
 
 
204 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  42.86 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  40.58 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  43.33 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 
69 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
93 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  37.97 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  37.1 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  42.67 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  41.07 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  36.23 
 
 
75 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
390 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  43.33 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  28.99 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  28.99 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
213 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
93 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  38.33 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
245 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>