More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0685 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 86 aa  174  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  70.67 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  66.22 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  66.22 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  62.32 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  68.85 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3064  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2824  hypothetical protein  59.26 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  42.25 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  37.1 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.11 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  38.67 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  37.88 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  37.66 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  42.37 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5196  hypothetical protein  38.16 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 371 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  36.67 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>