More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3387 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 93 aa  180  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3064  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.91 
 
 		 315 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 190 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0092  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.3 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  37.5 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  34.43 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  42.25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 207 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 208 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>