226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3064 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3064  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 94 aa  177  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  47.95 
 
 		 86 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  44.59 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  47.62 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.34 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  43.24 
 
 		 488 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  42.25 
 
 		 198 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  36.99 
 
 		 489 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 488 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  37.31 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 516 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>