More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3515 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  98.63 
 
 		 73 aa  147  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  76.12 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  77.61 
 
 		 91 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  59.7 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  62.5 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  56.72 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  44.78 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  39.71 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  42.42 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  39.71 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.19 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  39.73 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  40.3 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.94 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 188 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>