More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0697 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
90 aa  176  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  60.47 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  56.79 
 
 
93 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  62.32 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  53.09 
 
 
93 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  58.23 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3064  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333734  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.76 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.07 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
112 aa  57  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  37.14 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  39.34 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2824  hypothetical protein  50.98 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 
94 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
333 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 
333 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  42.37 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  35.21 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1786  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
82 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.365144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
72 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
89 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  35.38 
 
 
80 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
209 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
207 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 
210 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  38.46 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  34.43 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>