161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1297 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 182 aa  344  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4464  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 255 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  45 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  45 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  45 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 86 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 120 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 84 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 61 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 73 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 73 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 73 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 81 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 93 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 89 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 72 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 72 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 112 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 300 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 67 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 333 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.33 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 333 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  30.95 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 86 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 259 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  46.67 
 
 		 81 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 79 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  41.25 
 
 		 81 aa  45.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 63 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 101 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 91 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 70 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  39.76 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 78 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4035  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 80 aa  44.7  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 497 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 90 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 390 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2441  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 76 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 85 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 411 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 76 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 89 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 77 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  43.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>