More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1478 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  144  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  43.94 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 72 aa  57  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  44.64 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  41.18 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.07 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  50.94 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  47.37 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  42.86 
 
 		 352 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  46.88 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  51.92 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  39.29 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  46.81 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  42.55 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>