More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2435 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 218 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  43.3 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  39.71 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  34.65 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 516 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 183 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.18 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  41.54 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  36.71 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  42.59 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  29.25 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  32.08 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3917  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 208 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.36 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  41.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>