More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2559 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 71 aa  140  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  50 
 
 		 421 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  50 
 
 		 421 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  45.76 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 333 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 333 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  36.76 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  44.07 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.98 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 181 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>