287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0995 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  44.29 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.94 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.1 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 229 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 230 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0714  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  34.92 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0728  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0229  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0893  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.88 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0594  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  36.51 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 369 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2441  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2717  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2361  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2607  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6018  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2718  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35.71 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2078  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0608  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2743  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2690  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  37.29 
 
 		 338 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>