132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2958 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 70 aa  137  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  46.88 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 72 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 72 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  41.54 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  36.07 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.93 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  38.24 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  42.59 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 228 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 516 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  36.07 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3195  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0958967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 402 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  36.76 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2538  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0200677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.26 
 
 		 201 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 191 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 69 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 82 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  34.43 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 200 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 67 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 488 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 503 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 197 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  42.62 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  42.62 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 390 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.2 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  32.2 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  34.85 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 490 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>