More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2384 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 82 aa  160  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 245 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  34.72 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.88 
 
 		 323 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 228 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 490 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  36.76 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  42.37 
 
 		 488 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.32 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  41.89 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.38 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 183 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 489 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.54 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 500 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  27.69 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  41.07 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2727  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  44.93 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.24 
 
 		 317 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>