More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3812 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  157  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 75 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 71 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  43.94 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  40.58 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  44.62 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  44.12 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  39.39 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0127  DNA-binding protein  40 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.797375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 177 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 199 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  31.08 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  31.08 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  39.68 
 
 		 467 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.86 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  44.44 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>