More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0368 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  153  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  69.12 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  41.89 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  45.68 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  44.62 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  39.73 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  42.37 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.31 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  47.95 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  decreased coverage  0.000887341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04285  DNA-binding protein, putative  43.4 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  38.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  38.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  38.36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0227  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  40 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>