19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9804 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9804  helix turn helix transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6378  XRE family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4548  helix-turn-helix domain-containing protein  48.3 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  47.59 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4162  hypothetical protein  43.24 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0787626  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9872  hypothetical protein  42.2 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4600  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 78 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 		 119 aa  44.3  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  31.34 
 
 		 85 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  28.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 124 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>