More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0965 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  91.1 
 
 
191 aa  357  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  56.45 
 
 
189 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  55.28 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
186 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  43.09 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  45.51 
 
 
182 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  43.17 
 
 
232 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 
195 aa  135  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  38.8 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  41.98 
 
 
203 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  29.19 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.15 
 
 
236 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  28.73 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.77 
 
 
236 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  28.8 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.24 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
292 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.34 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  28.27 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.21 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  29.48 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  33.69 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.26 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  28.79 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  27.37 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  30.46 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  25.84 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  24.48 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  27.37 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  23.46 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  23.46 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  23.46 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>