More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1021 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  59.14 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  60.21 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  58.64 
 
 		 201 aa  220  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  58.6 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  62.16 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  58.6 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  59.79 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  58.38 
 
 		 223 aa  209  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  58.56 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  56.42 
 
 		 199 aa  200  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  55.08 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  60.11 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 191 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  55.31 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  57.22 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  54.8 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  57.22 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  56.91 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  49.45 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  52.2 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  50.32 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  45.99 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 169 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.27 
 
 		 126 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  37.57 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 220 aa  88.2  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  32.64 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  26.34 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  22.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  28.34 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  25.53 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  24.35 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  26.54 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  25.88 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>