More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2440 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 220 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  39.79 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  39.58 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  37.37 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  35.32 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  37.37 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 		 190 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  39.8 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  35.76 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  30.37 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  32.2 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  24.75 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  23.23 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  27.6 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  26.56 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  25.89 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  25.37 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  24.02 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  23.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  23.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  23.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.74 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  26.53 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  28.49 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  31.77 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>