More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1667 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  66.32 
 
 		 195 aa  255  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  66.14 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  62.05 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  62.56 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  61.58 
 
 		 201 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  64.02 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  59.49 
 
 		 192 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  62.19 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  62.89 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  58.42 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  61.46 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  58.29 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  54.92 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  57.44 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  62.84 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  56.76 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  54.59 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  55.43 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  53.65 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  55.8 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  51.87 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  52.66 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.46 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  38.34 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  39.49 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  39.01 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.54 
 
 		 126 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  28.49 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.79 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.95 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  32.75 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  32.54 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  28.57 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  33.14 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  26.83 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  31.14 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>