More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2571 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  37.95 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  34.24 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  35.36 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.36 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  35.36 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  34.62 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 292 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  32.4 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  32.4 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  34.08 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  32.4 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  32.4 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  33.7 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  34.08 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  34.08 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  34.08 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.42 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.7 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  35.52 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  38.69 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  35.2 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>