More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3652 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  84.69 
 
 		 215 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  80.51 
 
 		 201 aa  314  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  78.68 
 
 		 202 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  77.3 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  66.84 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  67.38 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  68.59 
 
 		 195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  72.49 
 
 		 194 aa  251  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 194 aa  250  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  65.79 
 
 		 194 aa  248  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  67.38 
 
 		 192 aa  244  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  64 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  65.45 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  59.69 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  66.31 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  66.49 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  61.08 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  65.03 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  60.96 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  65.26 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  59.79 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  57.38 
 
 		 197 aa  218  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  60.51 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  65.66 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  57.45 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  54.6 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  53.05 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.45 
 
 		 126 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  45.03 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  44.07 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  40.72 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  41.01 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  40.34 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.28 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 281 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.64 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 292 aa  71.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  32.92 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>