More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0635 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  70.2 
 
 
201 aa  280  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  69.19 
 
 
202 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  66.84 
 
 
196 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  67.89 
 
 
194 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  68.75 
 
 
215 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  66.84 
 
 
195 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  67.54 
 
 
194 aa  252  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  69.35 
 
 
204 aa  252  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  64.82 
 
 
201 aa  250  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  64.1 
 
 
197 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  64.36 
 
 
223 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  62.84 
 
 
199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  62.11 
 
 
219 aa  237  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 
191 aa  236  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  63.83 
 
 
200 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  65.03 
 
 
192 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  67.21 
 
 
195 aa  234  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 
191 aa  233  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  67.02 
 
 
194 aa  232  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  62.03 
 
 
192 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  65.82 
 
 
210 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 
200 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  59.14 
 
 
191 aa  226  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  63.13 
 
 
197 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  62.05 
 
 
214 aa  222  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  61.17 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  54.12 
 
 
197 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 
190 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  54.26 
 
 
200 aa  177  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 
193 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 
193 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 
193 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  51.53 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  49.39 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  47.65 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 
169 aa  131  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.05 
 
 
126 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  43.39 
 
 
192 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  41.12 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.78 
 
 
196 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  39.89 
 
 
190 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.7 
 
 
201 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  38.92 
 
 
193 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 
198 aa  87.8  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  33.69 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  37.37 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  37.23 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.41 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  25.73 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  34.57 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  28.33 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  33.54 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  25.73 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  30.81 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  29.05 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  29.59 
 
 
269 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  27.01 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  29.78 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  25.15 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.18 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.18 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  27.01 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  31.01 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  24.39 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.18 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.18 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.18 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>