More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5086 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  64.71 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  62.57 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  62.03 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  63.87 
 
 		 204 aa  221  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  58.85 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 195 aa  217  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  62.84 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  60.99 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  59.89 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  58.51 
 
 		 197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  58.7 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  55.91 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  58.56 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  55.67 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  51.34 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  51.34 
 
 		 191 aa  190  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 197 aa  190  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  51.08 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  58.06 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  51.1 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  49.68 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  43.72 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.14 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.79 
 
 		 126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  38.3 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  33.51 
 
 		 182 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  22.75 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  23.12 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  25.58 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>