More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0165 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 178 aa  111  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  38.95 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 292 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  36.87 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2366  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.46 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.9 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  33.71 
 
 		 271 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  31.64 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  31.32 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  36.97 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  28.41 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  32.6 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  32.42 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  33.92 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  35.47 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  25.61 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>