More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1649 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  96.13 
 
 
181 aa  357  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  96.13 
 
 
181 aa  357  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  96.13 
 
 
181 aa  357  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  95.58 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  95.58 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  95.58 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  95.03 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  95.03 
 
 
181 aa  354  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  94.48 
 
 
181 aa  352  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  53.8 
 
 
184 aa  203  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  43.56 
 
 
213 aa  127  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  37.22 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  37.22 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  37.22 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  36.67 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  35 
 
 
186 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
197 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 
199 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
208 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
208 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
208 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
182 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
182 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
182 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  33.15 
 
 
152 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
182 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
182 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  33.52 
 
 
182 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  32.79 
 
 
182 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
204 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 
205 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  30.94 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
182 aa  97.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
199 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  32.04 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 
191 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.04 
 
 
191 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.55 
 
 
204 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.12 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
292 aa  90.5  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  30.6 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  29.12 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 
190 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  32.42 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 
190 aa  87.8  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
191 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
181 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.77 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.77 
 
 
236 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.94 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  32.96 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  29.94 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  28.96 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  29.35 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  27.93 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>