More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1480 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1480  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 184 aa  148  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.35 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 184 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.46 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  30.22 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  30.34 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  30.34 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.5 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  32.58 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.32 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  31.5 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  29.44 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  25.41 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  23.5 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  27.22 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>