More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1558 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  35 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 292 aa  97.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  29.05 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  30.6 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 281 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  30.6 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  28.82 
 
 		 283 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.61 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 269 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 271 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  28.96 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  28.74 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  28.74 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  28.74 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 286 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 234 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 292 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  34.08 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 259 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 259 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 259 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  33.95 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  33.95 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 201 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  29.61 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>