More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2513 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  100 
 
 
152 aa  309  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  81.72 
 
 
186 aa  294  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  81.72 
 
 
186 aa  294  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  81.72 
 
 
186 aa  294  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  81.18 
 
 
186 aa  293  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  79.57 
 
 
186 aa  287  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  79.03 
 
 
186 aa  286  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  77.42 
 
 
197 aa  277  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
181 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.31 
 
 
181 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
181 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
181 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  32.58 
 
 
181 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  30.94 
 
 
184 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  44.64 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 
192 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  27.37 
 
 
201 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  28.66 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  24.16 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.81 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 
193 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 
201 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  26.55 
 
 
191 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  26.37 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  26.37 
 
 
236 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  26.37 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  26.37 
 
 
236 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  23.5 
 
 
196 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  21.91 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 
195 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 
179 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  26.52 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  21.3 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  22.99 
 
 
204 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  25.45 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  34.58 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  25.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 
207 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  21.47 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  24.6 
 
 
234 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  21.47 
 
 
191 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  25.45 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
224 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  24.39 
 
 
184 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  24.69 
 
 
185 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  26.01 
 
 
175 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  35.14 
 
 
225 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  21.3 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  22.4 
 
 
188 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  25.54 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  26.54 
 
 
185 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  25.54 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>