85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2209 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  100 
 
 
186 aa  176  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  100 
 
 
186 aa  176  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  100 
 
 
186 aa  176  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
186 aa  176  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
85 aa  174  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  98.82 
 
 
186 aa  174  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  97.65 
 
 
186 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  92.94 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  60.71 
 
 
112 aa  110  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  100 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  32.93 
 
 
184 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  34.21 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  35.9 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  32.2 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  42.59 
 
 
334 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  32.2 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.65 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
188 aa  42.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  30 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  30 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  30 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  29.63 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  36.23 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
292 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.43 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.76 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36.54 
 
 
332 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.25 
 
 
112 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  26.19 
 
 
155 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  28.57 
 
 
116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  26.51 
 
 
182 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.38 
 
 
191 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  28.57 
 
 
116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  23.75 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 
377 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.75 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  35.09 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  31.67 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  21.95 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
333 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  26.25 
 
 
191 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.15 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.87 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
191 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
191 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 
218 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  29.23 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 
191 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  30.51 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
192 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 
205 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
193 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
192 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
192 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  34.62 
 
 
114 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>