More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1046 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  84.15 
 
 		 187 aa  311  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 191 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  46.07 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  42.02 
 
 		 232 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  49.69 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  44.57 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 225 aa  131  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  41.14 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  41.98 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  35.36 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 292 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  33.14 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  31.89 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30.57 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  28.25 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  29.61 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  30.11 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  30.94 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  30.17 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  26.7 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  31.64 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.96 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  27.98 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4838  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0168811  hitchhiker  0.0000750229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  34.08 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.07 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>