More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0599 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 193 aa  376  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 191 aa  201  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  55.17 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  51.65 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  52.27 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  50.83 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  48.88 
 
 		 225 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  44.25 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  48.35 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 292 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.08 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  32.8 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 234 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  29.14 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  32.62 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  32.98 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  29.78 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  35.94 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  26.86 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  30.51 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  31.87 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.24 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  30.22 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  30.22 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  29.55 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.41 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>