More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1729 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  59.67 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  59.78 
 
 		 232 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  52.75 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  50.56 
 
 		 182 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  47.75 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  41.51 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  37.99 
 
 		 197 aa  97.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 178 aa  94.4  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 292 aa  89  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.35 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  32.34 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 175 aa  77.8  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  28.65 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  32.4 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  30.54 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.56 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.36 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  31.1 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  31.1 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.09 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.52 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.09 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>