More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04340 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  56.45 
 
 
191 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  43.6 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 
186 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  43.93 
 
 
195 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  42.44 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 
203 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  35 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.46 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  32.97 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.43 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  30.6 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  34.95 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.96 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.96 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  33.52 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.23 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.23 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  29.24 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.23 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  34.3 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  28.98 
 
 
175 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  31.79 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  30 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  30.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  30.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  30.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  30.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  30.59 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  30.77 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.48 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  30 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  25.86 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  28.98 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  28.98 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  29.44 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1934  DNA-binding protein  26.86 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.32 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  32.16 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  30.06 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.06 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  32.09 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  30.51 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 
432 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  27.75 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>