More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0274 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0715  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  43.78 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04340  predicted transcriptional regulator  40.13 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0599  transcriptional regulator, XRE family  43.83 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1418  transcriptional regulator, XRE family  39.88 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.560909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 292 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  30.56 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  28.73 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 175 aa  84.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 184 aa  84.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  31.84 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  32.22 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  32.64 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  30.17 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.61 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>