More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7925 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  69.73 
 
 		 191 aa  280  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 191 aa  278  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  65.78 
 
 		 197 aa  258  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  64.55 
 
 		 192 aa  245  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  62.84 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  61.14 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  59.46 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  61.96 
 
 		 215 aa  234  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  61.08 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  58.85 
 
 		 194 aa  231  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  58.95 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  60.11 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  62.78 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  56.59 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  57.38 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  58.47 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  57.61 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  55.79 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  56.42 
 
 		 191 aa  200  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  56.12 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  59.26 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  51.08 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  50.76 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  51.09 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  47.51 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  50.31 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.82 
 
 		 126 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  40.96 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.01 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  38.17 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  38.5 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  40.11 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.9 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  27.91 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  33.14 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  31.9 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  29.44 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  28.16 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  29.44 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  34.16 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  32.37 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  25.28 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  29.71 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>