More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2365 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 193 aa  370  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  55.5 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  58.62 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  51.87 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  58.62 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  51.05 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  53.68 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  52.15 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  49.22 
 
 		 190 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  51.15 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  49.47 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  54.02 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  56.91 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  54.3 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  51.93 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  49.46 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  52.22 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 214 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  47.8 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  46.7 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  49.17 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  43.1 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  42.2 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.89 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  34.25 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  28.24 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  28.65 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.65 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>