More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2992 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  73.91 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  63.04 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  52.17 
 
 		 192 aa  180  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  49.46 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  42.46 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  37.71 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  36.9 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 200 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.25 
 
 		 197 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  38.59 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  35.05 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  32.64 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  36.22 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  33.69 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  37.36 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  27.59 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  27.84 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  32.16 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  28.39 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  50.79 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>