More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1819 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  82.29 
 
 		 192 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 192 aa  213  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  44.27 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  44.27 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  36.08 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 197 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 198 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.24 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  29.83 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  28.65 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  31.11 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  27.98 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  27.32 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  30.49 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  26.78 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  24.47 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.5 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  25.81 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>