More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0154 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  69.02 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 184 aa  261  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  66.85 
 
 		 184 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  65.22 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  63.59 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  63.04 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  59.78 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  55.19 
 
 		 183 aa  213  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 186 aa  148  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  37.57 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  35.75 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  37.85 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  38.83 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  35.83 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 503 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  29.05 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  29.94 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  29.89 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.35 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  30.08 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  28.02 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4828  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0464638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  28.02 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.22 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  31.21 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  26.14 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>