More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1906 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  61.66 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  60.59 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  63.44 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  61.29 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  61.29 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  61.29 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  59.78 
 
 		 209 aa  228  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  54.84 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  54.97 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 199 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 208 aa  204  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  38.07 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 150 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  33.89 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  28.71 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.39 
 
 		 189 aa  88.6  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 187 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  33.9 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  31.87 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  31.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  31.87 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  32.42 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  27.92 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  28 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  28.8 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  27.98 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.38 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.38 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.38 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  27.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>