More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1227 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  32.79 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  32.78 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  29.74 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  30.32 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  30.89 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  31.35 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  30.81 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  27.78 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  29.1 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  28.65 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  29.74 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  25.97 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.57 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  28.42 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>