More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2727 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  74.5 
 
 		 207 aa  326  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  73 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  72.5 
 
 		 207 aa  322  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  70.26 
 
 		 215 aa  297  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  60.58 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  60.59 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4037  DNA-binding protein  58.88 
 
 		 199 aa  245  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2483  DNA-binding protein  57.44 
 
 		 198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  54.37 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 208 aa  217  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  52.08 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  39.23 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 252 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1876  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3493  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2245  Cro/CI family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492638  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2007  DNA-binding protein  33.15 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  33.67 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  33.52 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  34.81 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  29.02 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  34.27 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  32.96 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  32.96 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  32.96 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  32.96 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  24.49 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  26.49 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  31.28 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  27.84 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  30.73 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.57 
 
 		 503 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  30.9 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>