More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3456 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  99.5 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  73.47 
 
 		 196 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 198 aa  274  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  67.01 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  50.75 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  38.92 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  36.22 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  33.89 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  29.19 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  32.07 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  31.63 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  31.35 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.89 
 
 		 503 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.6 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  27.6 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.05 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.05 
 
 		 236 aa  87.8  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 176 aa  87.8  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  32.81 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  32.63 
 
 		 503 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  28.65 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  28.88 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>